Closed Hdd lagging?

Good afternoon ka-PHC, bakit po kaya nag lalag ang process kapag sa isang hdd ako nagbubukas nang mga application? Hindi katulad sa isa kong hdd ayos naman po. For example po, sa C: po ako nagbukas pero ayos naman po. Pero kapag sa F: may instances na maglalag/titigil na kapag may process na ongoing sa F:. At paano po ba burahin yung system reserved? At paano po mag repair nang hdd, dahil may bad sector po siya? Maraming salamat po sa makakatulong sa akin.